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Présentation de l’atelier

par admin-atelier "Gestion de données & développement logiciel " - 19 février 2014 ( maj : 9 juin 2017 )

Objectifs

Les objectifs de l’atelier sont de faire partager les savoir faire autour du développement logiciel et la gestion de données scientifiques et de favoriser ainsi le développement des compétences et l’identification des bonnes pratiques.

Animation

Liste de diffusion
La liste rdatadev ( https://listes.univ-grenoble-alpes.fr/sympa/info/rdatadev ) regroupe les discussions sur les deux thématiques confondues et autres informations pratiques ( dates de réunions, annonces de conférences...).

Comment s’inscrire ?
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Comment consulter l’historique des échanges de mails ?
En suivant les liens vers l’archive : rdatadev

Réunions régulières

  • 26 janvier 2017 : Discussion autour d’un outil de gestion de base de données de télémétrie Radar (Yves Roger, Melodie Roudaud - IPAG) (Slides)
    • Présentation des besoins utilisateurs et spécifications fonctionnelles
    • Discussion de ces spécifications
    • Quels choix techniques ?
    • Echanges / retours d’expériences
  • 16 décembre 2016 : Restitution des journées ISS 2016 Informations Spatialisées Sémantisées (Véronique Chaffard - IGE) (Slides)
    • Le web sémantique appliquée à des données à référence spatiale
  • 18 octobre 2016 : Restitution des journées SIST 2016 Séries Interopérables et Systèmes de Traitement (Véronique Chaffard - IGE, Guillaume Mella - IPAG) (Slides)
    • Standards d’intéropérabilité de l’OGC (Open Geospatial Consortium) pour la découverte et l’échange de données à référence spatiale et les traitements associés
    • Plateformes de données scientifiques
    • DOI
    • Archivage de données
    • Interopérabilité
  • 23 septembre 2016 : AppLauncher - faciliter l’intéropérabilité entre services et logiciels (Guillaume Mella - IPAG)
  • 7 juin 2016 : Présentations et retours d’expérience de Frameworks python pour le développement d’applications web.
  • 13 octobre 2015 : Restitution de quelques thématiques des journées JDEV2015 (Slides)
    • T2 : Modélisation et ingénierie
      • Modélisation (UML + ) / méthode SCRUM - Guillaume Mella (IPAG)
    • T3 : Données massives scientifiques (Big data), recherche par les données
      • Bases NoSQL (atelier Oracle + 1 mot sur les autres) / atelier mapreduce (ex hadoop ; spark) – Caroline Bligny (LJK)
      • Atelier Prise en main Elastic Search et de Kibana - Véronique Chaffard (LTHE)
      • Atelier python+scikit-learn (modélisation prédictive) / Groupe de travail : python&optimisation - Yves Rogez (IPAG)
      • Julia - Laure Tavard (LGGE)
    • T5 : Infrastructures et interopérabilité : Le cloud et les architectures orientées service (SOA)
      • Infrastructures de données spatiales – Eric Maldonado (IRSTEA)
    • T6 : Les usines logicielles, le DevOps et la virtualisation
      • Conteneurs et outils de production de code / Groupe de travail : Comment favoriser l’approche Devops - lien entre les développeurs et les ASRs - Guillaume Mella (IPAG)
      • Docker - Eric Maldonado (IRSTEA)
    • T7 : Javascript (paradigmes et éco-systèmes)
      • Atelier Bootstrap - Véronique Chaffard (LTHE)
      • Groupe de travail : sécurité et bonnes pratiques - Caroline Bligny (LJK)
    • T8 : Logiciels scientifiques et simulations : nouveaux modèles et enjeux
      • Présentation thème, Atelier structuration données - Laure Tavard (LGGE)
      • Atelier GPU / Groupe de travail : validation - Yves Rogez (IPAG)
  • 4 juin 2015 : Présentation du centre CIMENT (Françoise Roch, OSUG) (Slides)
    • CIMENT (Calcul Intensif / Modélisation / Expérimentation Numérique et Technologique) est le centre de calcul haute performance des universités grenobloises , encore appelé mésocentre de calcul de Grenoble.
      Il fournit des ressources de calcul aux étudiants et chercheurs grenoblois pour le développement de leurs codes, avant le passage sur les centres nationaux.
    • l’organisation pyramidale du calcul en france et la place de CIMENT dans cette organisation
    • la structure du projet CIMENT
    • l’architecture du mésocentre (les clusters, la grille de calcul, la grille de stockage)
    • son environnement logiciel (l’espace personnel des utilisateurs : Perseus, le gestionnaire de job OAR, l’interface grille CiGri, l’environnement de développement)
    • les formations CIMENT
  • 10 avril 2015 : Exploitation de grands ensembles de données avec ParaView / VTK / HDF5 sur le projet SimSERT (Yves Rogez, IPAG) (Slides)
    • Contexte : CONSERT / ROSETTA - SimSERT
    • ParaView :
      • Fonctionnalités, notion de pipeline VTK
      • Traitement et visualisation sur cluster (utilisation avec CIMENT)
      • Retour d’expérience
    • Structures de données : VTK et HDF5
  • 5 février 2015 : Maven, outil pour la gestion et l’automatisation de production des projets logiciels (Laurent Bourgès, IPAG) (Slides)
    • Présentation générale : objectifs, principales caractéristiques
    • Configuration pom.xml
    • Architecture standard des répertoires d’un projet Maven
    • Démonstration sur le projet JMMC
    • Plugins
  • 24 novembre 2014 : Retour d’expérience sur le projet OIDB : diffusion de données depuis une base XML (Patrick Bernaud, IPAG) (Slides)
    • Présentation du projet OiDB : base de metadonnées observationnelles en interférométrie optique pour l’astronomie et portail Web de consultation et d’indexation depuis des sources variées
    • Présentation de la BD XML native, eXist-db permettant notamment de réaliser des services Web RESTful en XQuery
    • Mise en oeuvre dans le portail OiDB et son intégration avec l’existant
    • Retour d’expérience sur l’architecture et les choix techniques faits. Choix d’un système de stockage hybride XML + SQL et l’intégration du service avec les protocoles et standards de l’Observatoire Virtuel

Mots clefs : NoSQL, XML, XQuery, jQuery, Bootstrap, VO, TAP, metadata

  • 9 octobre 2014 : doi pour les jeux de données (Slides)
    • Présentation par Catherine Pequegnat (ISTERRE) des décisions prises en terme de doi sur le projet Resif
    • finalisation des démarches de réflexion/questionnement.
  • 4 juillet 2014 : doi pour les jeux de données
    • Visio-conférence avec l’INIST : quelle granularité pour le découpage en jeux de données ?, contenu métadonnées dataCite
  • 3 avril 2014 : doi pour les jeux de données (Slides)
    • Visio-conférence avec l’INIST pour clarifier un certain nombres de points autour de l’attribution de doi dans le cadre d’une démarche collective OSUG.
  • 27 février 2014 : présentation des outils de gestion de code (Laurent Torlay, OSUG et Pierre Volcke, ISTerre) (Slides)
    • description des services accessibles à l’OSUG (forge.osug.fr) et sur RENATER (sourcesup)
    • démo utilisation SVN + trac
    • échanges, questions...

 

Animateurs : Guillaume Mella (IPAG), Véronique Chaffard (IGE)


       

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