ABBA : ADN environnemental pour caractériser la Biodiversité du sol et végétale de petits BAssins versants

Laboratoire(s)/équipe(s) du LabEx OSUG impliqué(e.s) : Irstea, LECA, IGE
Porteur du projet : Caroline Le Bouteiller

Résumé

Nous proposons de tester une nouvelle méthodologie de caractérisation de la biodiversité du sol et végétale d’un bassin versant. Cette méthodologie est basée sur des mesures de metabarcoding de l’ADN environnemental réalisées sur des échantillons de matières en suspension prélevés à l’exutoire du bassin. Le metabarcoding consiste à collecter et amplifier les fragments d’ADN extracellulaire contenus dans un échantillon environnemental, puis à identifier les unités taxonomiques présentes en comparant cet ADN à des bases de données de référence. Ce projet sera réalisé sur des petits bassins versants des observatoires Draix-Bléone et OHMCV (sites Ardèche). A partir de prélèvements réalisés dans les matières en suspension à l’exutoire et dans les sols au sein des bassins, nous proposons de caractériser la signature ADN de ces petits bassins versants et d’évaluer si ce signal est représentatif de leur biodiversité.

Soutien attribué en 2016 : 14 488 €